Métaheuristiques et automate cellulaire pour la génération automatique d’organes humains (in French)
Last Updated (Monday, 08 June 2009 06:26) Friday, 05 June 2009 10:06
Normal 0 21 false false false MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:"Table Normal"; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colband-size:0; mso-style-noshow:yes; mso-style-parent:""; mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-para-margin:0cm; mso-para-margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:10.0pt; font-family:"Times New Roman"; mso-ansi-language:#0400; mso-fareast-language:#0400; mso-bidi-language:#0400;}Métaheuristiques et automate cellulaire
pour la génération automatique d’organes humains
Directeur de thèse : Michel Gourgand (LIMOS)
Co – encadrants : Laurent Deroussi (LIMOS), David Sarramia (LPC)
Laboratoires : LIMOS CNRS UMR 6158
LPC CNRS UMR 6533
E-mails : This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it , {deroussi, sarramia}@moniut.univ-bpclermont.fr
DEADLINE: 1 JUILLET 2009
Ce sujet se place dans la mouvance de la modélisation et la simulation d’un être humain synthétique de façon à pouvoir comprendre les interactions intervenant dans le corps humain. En particulier, le projet européen VPH (Virtual Physiological Human) du FP6 européen est à rapprocher de ce sujet de thèse. Un des grands challenges est de produire des modèles de santé personnalisés patient. La différence majeure entre le projet VPH et le sujet proposé est que VPH consiste en le développement de modèles d’organes par des équipes de recherche différentes de façon indépendante pour ensuite les assembler tandis que l’approche proposée ici consiste à générer n’importe quel organe pour tout patient à partir du même modèle à base d’automates cellulaires.
Le sujet proposé se déroulera en collaboration avec une entreprise qui développe une plateforme logicielle. Cette dernière s'intéresse à la modélisation du corps humain, par l'utilisation d'automate cellulaire et de systèmes multi-agent. Le but est de pouvoir modéliser et simuler l'ensemble du corps humain (ses organes, les artères,...) pour des applications de e-learning et de tests de médicaments.
Actuellement, l'évolution de l'automate cellulaire est guidée par le concepteur. Il serait beaucoup plus séduisant qu'un algorithme s'en charge. La sélection de règles pour atteindre une configuration d'automate fixée (un organe donné) semble envisageable par l'utilisation de métaheuristiques inspirées de la nature telles que les algorithmes mémétiques ou les essaims particulaires.
La contribution principale de cette thèse concerne la proposition de métaheuristiques pour la sélection de règles d'évolution d'un automate cellulaire multi-échelle modélisant des processus biologiques, et plus particulièrement le corps humain.
Cette thèse concerne donc :
§ la modélisation et la simulation de systèmes complexes (bio-informatique,…),
§ la proposition de métaheuristiques pour le guidage d’automates cellulaires 3D,
§ la constitution d’une base de formes et de configurations pour générer des organes,
§ l’utilisation de la plateforme GATE (EGEE).
Connaissances et compétences requises : le candidat travaillera avant tout sur la proposition et le développement de méthodes informatiques. De bonnes compétences dans ce domaine sont donc indispensables. L’aspect pluridisciplinaire de ce sujet de par son domaine d’application nécessitera également de la part du candidat une curiosité scientifique. Si un profil bio-informatique peut constituer un plus, les connaissances en biologie pourront être acquises pendant le déroulement de la thèse.
Mots-clés : métaheuristiques, algorithmes mémétiques, automates cellulaires, self-configuration.